Makedonya’da Türk hakimiyeti ilk olarak M.S 7. yüzyılda Bulgar Hanlığı’nın fetihleri ile kuruldu. Daha sonra Bizans ve Bulgar Devleti arasında sürekli el değiştiren Makedonya 1389 yılında Osmanlı egemenliğine girdi. Osmanlı Devleti’nin Rumeli’deki yönetim merkezi olan Makedonya 15. ve 16. yüzyılda Türkmen göçleriyle Müslümanlaştı.
Birinci Balkan Savaşıyla Osmanlı hakimiyetinden çıkan Makedonya, I. Dünya Savaşı’nın ardından Yugoslavya’ya bağlandı. Sırp Milliyetçilerinin baskın olduğu Yugoslav hükümeti Bosna ile birlikte Makedonya üzerinde sistematik bir Slavlaştırma politikası uyguladı. Bu dönemde Türk ve Müslüman halkın dini ve kültürel geleneklerini yaşamaları noktasında ciddi sıkıntıları olmuştur. Yugoslavya’nın dağılmasıyla bağımsızlığına kavuşan Makedonya’da 200.000’e yakın Türk yaşamaktadır. Makedonya’daki Türklerin günümüzdeki en önemli meselesi nüfusun dağınık olması nedeniyle siyasi temsilin istenilen düzeyde olmamasıdır.